Gregor Pompe studierte vergleichende Literaturwissenschaft, die Deutsche Sprache und Musikwissenschaft an der Philosophischen Fakultät in Ljubljana. Für seine Diplomarbeit wurde ihm der Prešeren Preis für Studenten von der Philosophischen Fakultät verliehen. Zu Zeit arbeitet er als Professor in der Abteilung für Musikwissenschaft an der Philosophischen Fakultät in Ljubljana, wo er im Jahr 2006 auch seine Doktorarbeit vorstellte. Er lehrte Musikgeschichte an der Abteilung für Musik an der Pädagogischen Fakultät in Maribor und leitete ein Seminar an der Abteilung für Musikwissenschaft an der Karl Franzens Universität in Graz.

Als wissenschaftlicher Forscher beschäftigt er sich mit zeitgenössischer Musik mit Fragen über die Semantik von Musik und Musiktheater. Für seine Arbeit erhielt er den Mantuani Preis des Slowenischen musikwissenschaftlichen Vereins und zwei Preise von der Philosophischen Fakultät und dem Studentenrat dieser Fakultät für seine erfolgreiche pädagogische Arbeit. Er ist nebenbei auch als Publizist, Musikkritiker und Komponist tätig und leitet seit 2009 den Slowenischen musikwissenschaftlichen Verein.